The Legend of Zelda: Four Swords Adventures é o único título de console de Zelda até o momento a incorporar elementos multiplayer em sua campanha principal. Por causa de seus elementos single-player, Four Swords Adventures também é o primeiro jogo da série a permitir que um único jogador controle mais de um Link ao mesmo tempo, e utiliza vários métodos para permitir que o jogador faça uso dos quatro Links, como formações. Além disso, é o único título a dividir locais e templos em estágios e níveis sucintos e separados que podem ser reproduzidos mesmo depois de vencê-los uma vez. O jogo em si, embora seja uma inovação na jogabilidade de Zelda, é fortemente inspirado pela música, gráficos e locais de A Link to the Past.

Há muito tempo, no reino de Hyrule, um feiticeiro maligno começou a sequestrar jovens donzelas. Este feiticeiro era conhecido como Vaati, e parecia que ninguém poderia detê-lo. Eventualmente, apareceu um aventureiro que foi capaz de derrotar Vaati, este aventureiro carregou com ele a espada de quatro que fez com que ele fosse dividido em quatro seres, e trabalhando juntos os quatro seres foram capazes de selar Vaati nas profundezas da terra. Mas agora Vaati escapou, e a tarefa de derrotá-lo novamente caiu para Link!