Pokémon Infinite Fusion é um famoso RPG de Pokémon baseado na tendência do gerador de fusão Pokémon, com arte de sprites de uma grande comunidade de artistas. Nesta versão do Pokémon, a Silph Co. criou um splicer de DNA que pode funcionar em qualquer Pokémon, permitindo que suas estatísticas, aparência visual e digitação sejam combinadas com suas habilidades e movimentos disponíveis. O jogo inclui as regiões de Kanto e Johto e inclui mais de 570 Pokémon, incluindo os primeiros 386 Pokémon das três primeiras gerações, juntamente com um conjunto de Pokémon especificamente escolhidos de gerações posteriores. Com centenas de milhares de fusões disponíveis, nem mesmo o Professor Oak espera que você "pegue todos"!

O jogo segue uma história muito semelhante à de Pokémon Red/FireRed, exceto pela invenção e uso generalizado de Pokémon Fusion Splicers. Começando em Pallet Town, você recebe sua entrada do Professor Oak, seu rival prossegue para pegar os dois que você não escolheu e fundi-los para sua primeira batalha. O Team Rocket é o principal antagonista, tentando fundir três Pokémon lendários por métodos experimentais para dominar a região. Os líderes da academia e a história geral contêm algumas formas de Pokémon Red, no entanto, alguns ajustes foram feitos para explicar a nova mecânica, o mapa expandido, as entradas adicionais da Pokedex e o pós-jogo completo.